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一种与低氮条件下水稻千粒重相关的基因qTGW2-1及其分子标记，属于水稻高产抗逆育种和分子遗传学领域。利用不同的水稻品种为供体分别与同一轮回亲本杂交，然后与轮回亲本回交一次自交一次得到随机群体，将随机群体在低氮和正常施氮条件下进行处理，结合7388个SNP的bin基因型数据，定位到一个在低氮条件下稳定表达的千粒重新基因qTGW2-1。验证实验表明，实用经济型标记CLN9与该基因紧密连锁。将本发明应用于低氮胁迫条件下水稻千粒重的辅助选择育种和聚合育种，可以在低氮胁迫条件下对低世代的育种群体进行苗期基因型选择，省去成株期籽粒鉴定的过程，提高育种效率，加快育种进程。
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