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本发明提供一种萃取分离黄芩苷和黄芩素的方法，包括以下步骤：采用1_x005f_x005f_x005f_x005f_x005f_x001e_乙基_x001e_3_x001e_甲基咪唑六氟磷酸盐离子液体与水形成双相体系作为萃取剂，在超声辅助条件下对中药黄芩进行萃取；萃取温度为60 80℃；萃取完成后，离心并分离两相，得到分别富含黄芩苷的水相和富含黄芩素的离子液体相；步骤S2中所得离子液体相中加入甲醇，形成混合溶液，使黄芩素溶解于甲醇中，然后使离子液体沉淀，固液分离；本发明利用黄芩苷和黄芩素在两相中的分配系数不同，在一定温度中对黄芩苷和黄芩素进行萃取分离，可有效提取黄芩苷和黄芩素并进行分离回收；而且本发明方法简单，操作时间短。
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