本发明公开了一种制备鲑鱼降钙素的方法。本发明提供的方法依次包括如下步骤：(1)将含有表达盒的重组载体导入受体植物，得到转基因植物；所述表达盒自上游至下游依次包括如下元件：植物油体蛋白基因的启动子、融合基因和终止序列；所述融合基因中含有编码蛋白标签的区段丙、编码植物油体蛋白的区段甲、蛋白酶的酶切识别序列和编码鲑鱼降钙素的前体的核酸分子；(2)取转基因植物的种子，提取油体；(3)利用所述蛋白标签从所述油体中纯化所述融合蛋白；(4)用蛋白酶酶切融合蛋白；(5)分离鲑鱼降钙素；(6)醋酸化；(7)脱盐。采用本发明所提供的方法可以得到生物学活性较高的鲑鱼降钙素。因此，本发明提供的方法具有重要的应用价值。